Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA1Q5VX52 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPATA1Q5VX52 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms