Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF3Q5VWG9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF3Q5VWG9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms