Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
AGAP6Q5VW22 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms