Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT03

NUTM2D, NUT family member 2D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUTM2DQ5VT03 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUTM2DQ5VT03 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUTM2DQ5VT03 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms