Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms