Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
L1TD1Q5T7N2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
L1TD1Q5T7N2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1TD1Q5T7N2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms