Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC158Q5M9N0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC158Q5M9N0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms