Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC9

AKAP4, A-kinase anchor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP4Q5JQC9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
AKAP4Q5JQC9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AKAP4Q5JQC9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms