Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms