Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNI3KQ59H18 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms