Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP6Q3SY56 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms