Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBPF1Q3BBV0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF1Q3BBV0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms