Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms