Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CDO1Q16878 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDO1Q16878 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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