Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6V1FQ16864 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms