Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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