Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NTRK2Q16620 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK2Q16620 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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