Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTF1Q16619 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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