Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNCBQ16143 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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