Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF56Q15929 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF56Q15929 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF56Q15929 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF56Q15929 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF56Q15929 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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ZNF56Q15929 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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ZNF56Q15929 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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ZNF56Q15929 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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ZNF56Q15929 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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ZNF56Q15929 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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ZNF56Q15929 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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ZNF56Q15929 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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