Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX1Q15699 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
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