Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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CYTH1Q15438 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CYTH1Q15438 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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