Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SHPRHQ149N8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHPRHQ149N8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
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