Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB39AQ14964 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB39AQ14964 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms