Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP1BQ14684 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
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