Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DSC3Q14574 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
DSC3Q14574 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DSC3Q14574 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DSC3Q14574 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DSC3Q14574 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DSC3Q14574 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DSC3Q14574 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DSC3Q14574 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DSC3Q14574 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DSC3Q14574 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DSC3Q14574 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DSC3Q14574 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DSC3Q14574 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DSC3Q14574 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms