Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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