Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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CKAP5Q14008 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CKAP5Q14008 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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