Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF9Q13886 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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