Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL1Q13616 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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