Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms