Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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SKP2Q13309 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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SKP2Q13309 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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SKP2Q13309 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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SKP2Q13309 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP2Q13309 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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