Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms