Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3FQ13275 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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