Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPA4Q13156 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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