Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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