Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms