Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms