Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSRP1Q08945 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms