Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPOCK1Q08629 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCK1Q08629 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCK1Q08629 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCK1Q08629 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCK1Q08629 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCK1Q08629 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCK1Q08629 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCK1Q08629 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCK1Q08629 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCK1Q08629 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCK1Q08629 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCK1Q08629 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCK1Q08629 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCK1Q08629 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCK1Q08629 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCK1Q08629 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms