Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF11Q05519 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF11Q05519 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms