Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms