Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIBQ01892 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms