Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms