Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF2Q01130 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms