Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms