Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms