Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT85P78386 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT85P78386 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT85P78386 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT85P78386 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT85P78386 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT85P78386 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT85P78386 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT85P78386 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT85P78386 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT85P78386 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT85P78386 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT85P78386 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT85P78386 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT85P78386 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT85P78386 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT85P78386 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT85P78386 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT85P78386 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT85P78386 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT85P78386 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT85P78386 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT85P78386 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT85P78386 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT85P78386 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT85P78386 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT85P78386 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT85P78386 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT85P78386 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT85P78386 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT85P78386 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT85P78386 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT85P78386 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT85P78386 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT85P78386 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT85P78386 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT85P78386 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT85P78386 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT85P78386 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT85P78386 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT85P78386 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT85P78386 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT85P78386 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT85P78386 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT85P78386 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT85P78386 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT85P78386 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT85P78386 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT85P78386 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT85P78386 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT85P78386 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT85P78386 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT85P78386 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT85P78386 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT85P78386 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT85P78386 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT85P78386 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT85P78386 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT85P78386 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT85P78386 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT85P78386 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT85P78386 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT85P78386 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT85P78386 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT85P78386 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT85P78386 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT85P78386 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT85P78386 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT85P78386 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT85P78386 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT85P78386 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT85P78386 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT85P78386 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT85P78386 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT85P78386 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT85P78386 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT85P78386 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT85P78386 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT85P78386 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT85P78386 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT85P78386 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT85P78386 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT85P78386 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT85P78386 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT85P78386 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT85P78386 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT85P78386 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT85P78386 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT85P78386 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT85P78386 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT85P78386 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT85P78386 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT85P78386 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT85P78386 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT85P78386 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT85P78386 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT85P78386 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT85P78386 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT85P78386 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT85P78386 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms