Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2HP62256 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms