Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND3P61587 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND3P61587 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND3P61587 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND3P61587 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND3P61587 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND3P61587 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND3P61587 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND3P61587 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RND3P61587 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND3P61587 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND3P61587 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND3P61587 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RND3P61587 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RND3P61587 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RND3P61587 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RND3P61587 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RND3P61587 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RND3P61587 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RND3P61587 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RND3P61587 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RND3P61587 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RND3P61587 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RND3P61587 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND3P61587 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RND3P61587 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RND3P61587 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RND3P61587 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RND3P61587 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RND3P61587 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RND3P61587 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RND3P61587 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RND3P61587 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RND3P61587 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RND3P61587 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RND3P61587 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RND3P61587 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RND3P61587 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RND3P61587 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RND3P61587 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RND3P61587 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RND3P61587 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RND3P61587 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms